### Scipio v1.3 output
# query file    /tmp/w3PCbb2KA1Ka.fasta
# target file   /genomes/genomes_ncbi/Bombyx_mori_str__Dazao_v1_supercontigs.fasta
# BLAT output   /tmp/XXPrwJPNrx6X.psl
# Timestamp     Tue Jun  8 15:39:14 2010

--- 
Protein: 
- matchings: 
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 0
    nucl_end: 126
    prot_end: 42
    translation: MEHSLQHRERVGVQDFVLLEDYRSEAAFIDNLKKRFHENIIY
    dna_start: 18633
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 0
    seq: atggagcactccctgcagcatcgcgagcgggtcggagtccaagacttcgttttgctggaggactaccgatccgaagcggccttcattgacaatttgaagaaacgtttccatgaaaacattatttat
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 18759
  - dna_start: 18759
    type: intron
    nucl_start: 126
    seq: gtaagtattgtatttgttaacagtaattgaagggttggaaattttaagaacaacatatctatagatatagagaaaagattttctttcgtaatttttcggaaaagttcgtatttatcgtgctatcttaaatagcttcagtgcccatcaaaatagcaaattaaaaaatagcaacaactcagagtattttggcaaagttattttatggtcaccataacaattattactttaaaatatcgggaactcatttcgtataatacacttgtaaatatcccgttttaagtaataattgttatggttgtaacatctctatattatacgatgacattattcattttgacatttgacgctaaacaataaagttccatattaatggatatgaaaatgtcactcatttaatatgatcattcattgacagttcgagtgtcatcgtattccgataaaaatcagagttttctcgaaggaaaataatttctcactacatctattctagctcttagacatcacaatttgagactccttgaggcccgaggcaaaagacttaacaaatatatagacaattttgttgcttcctaccctcaaattggatcgaaggacggttgaaatgtgatgtagacattataatttgtaacggctattatcacgtaatagaataaatcgaaaaaatctctactgaagtctccagcgaaaaaactcgggtcgatccactcggtgggagatcaccataaaaaattcaaaaaggcaattgagactctaacgttataccttaagttaccattcacattgagatgtgtatgacgtctggtgacttcaactagtccgtgagcacttttgcccattacaagtaatacacagctacgtatttctaatatcttaaaaggatgttataaaaaagcattttactagtagtaaggagtcttgtgagtccgcacgcgcaggtaccaccggcctatttctgccgtgaagcaataatgcgtttcggtgtgaagggtgtggcagccgttgtactgtaaaacgtccacccatcttggcaataaataaataaaaataattattattattcattccgcag
    dna_end: 19828
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 42
    nucl_end: 242
    prot_end: 81
    translation: TYIGNVLISVNPYKNLPIYTEEKTKLYFKKAFFEAPPHV
    dna_start: 19828
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 126
    seq: acttacatcggtaatgtactgatctcggtgaatccgtacaagaatctaccgatttacactgaagagaaaaccaaactttacttcaagaaagcattctttgaggcaccgccgcacgt
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 19944
  - dna_start: 19944
    type: intron
    nucl_start: 242
    seq: gtgagtattactacatttacacaagcacacaacatacaaacaggacacactcaggccttcaaaaatatttaattaaaaaacatgtgattccgaaagagaattatattcagtattgaactatgagattaaatggatagataaaatctcatttactgccgtgacgcatcctgcctgatttatgcttaaagaatagagtagatttgaccgtaaattattgctattaatagcttttttctggagatacgcatttgtttttcgaactaacgtacttaactggtaagtgcggttgtcaccaattaatttcatctcaacataagactaaacaatacaagacatgagtactcttagtttgttgtatgctatttcattgtgcgtgacgtcatttgtggctgaaatgtattacaagccgaacgtattacaagccaaagcataacgattaatcatgtatgctatgatagaggtttaggcttattcacaaacactacacaagcgcaacgtgtgaatgtgttgaacgcgagctacatggtaggcggagtgaagggtgtaaggtttttttcgttacggaatttcatgattcagtcgccgcgctcaaggcccgcgataaaatctatgcaataacttaaaaaattggttgtctgtaaaatcagtttacggacgatagttttacgagataacatcagtagcagaattattcgaagtgctaggtctgacgttacgcgagaagagagataaatgtgtcacaaggcaacgcttttatttatttattgcctagatgggtgaacgagctcacgagctcacaacccacctgatgttaagtggttactggagaccatagacatctacaacgtaaatgcgccacccaccttgagatataagttctaaggtctcagtatagttacaatggctacccacccttcaaactgaaacgcattactgctttacggcagaaataggcagcgtggtgggcttgggccgatcgtgcctctctatcgcttgttccgcgctctcgcttgcacgctcaggctcaggcggaacgtgacactttttcgtgcgtgcagccggtgttcattgattcataagacgttatcacgttagcattttataaaactttaaattctaaacgaaaacttttatgaacacgtaatcaacaaaagccattaatgtattcctcgtatcgtcgtgataagaacacagtattgtacgataccctacatcgttcaatattatctaacccaaatatgaaattaaataacaataggattgaactgataaatttatttatattaattttgaagtaaaatccttcgatagtcatcgtaaacaataaaaataggtttgacggtaggtcctccttagtatacagatgataatgattaaacttgaactggtagatattattcagaggcaacgctatccttccttcacttcaatcatcagaacaactcctcaacagcataactagaaacctaaaaaaatctaaaataaaaaagaaaaggatatcaataacgtgtgtgtatgcgtgcgtgcgtatttgtgcatgcgtgcgtgtttgcgtgcgtttgagggtacgtgagcgcgcgcgtgtgtgagtgcgtgcgtgcgtgcttgggtgcatgtatgtatgagggtgagtgtgcacgtgcgtgcgagcgagcgtggatacgtgtgtaaatttattagatgatacccgcaataataaaaataaaatataggcttaaggtgcaaattcataataaaaaaatctgttttcag
    dna_end: 21696
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 81
    nucl_end: 313
    prot_end: 104
    translation: FAIADNAYRSLVYEHREQCILIS
    dna_start: 21696
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 242
    seq: tttcgcgatcgccgacaacgcttatcggtctttggtttacgagcacagagagcaatgtattttgatctcag
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 21767
  - dna_start: 21767
    type: intron
    nucl_start: 313
    seq: gtaatttattcattactttaagaacgccatttttgaggggatacttagttattaagtggggggagggtggcttgacgacacctctggccccgctaaagtccaacaatacaatagatggtgcatgtttacggagtgaaagcgcccgtaaaagtcttcatgactctttcatagcgatagtttccaatgaccaaaaggtacgcccatcaaaaaacagtttgtggtaggtagcggcttggctctaccctgacattgctgaagtccatgggcgaccataaccactcaccatcaggtgggccgtatgctcgtctgcctacaagggcaataaaaaaaacacatacctagaatcagtttgaaaataaaacaattcaacattcactgtaaccaatgataataatatcaaggcttatctatctacttccgttgcaaaggaacgtaacgtgattagtgcgtgaaccacaaaaaaaaacaaaattgtgaccaaatgttccgtctgacccgtacag
    dna_end: 22270
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 104
    nucl_end: 705
    prot_end: 235
    translation: GESGSGKTEASKKVLEYIAARTNHLRNVENVKDKLLQSNPLLEAFGNAKTHRNDNSSRFGKYMDIQFNYEGGPEGGHILNYLLEKSRVVSQMHGERNFHIFYQLLASSDQSLMTHLKLQGRPEAYKYTSDS
    dna_start: 22270
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 313
    seq: gcgaatccggctcgggcaaaacggaagcgtcgaagaaagttctggaatacatagccgccagaacgaaccacctccggaacgtggaaaacgtgaaagataagctgttacaaagcaacccgctgctcgaagcgttcggtaacgcgaagacgcaccgcaacgacaattccagtcgcttcggcaaatacatggacatccagttcaactacgaaggcgggcccgaaggtggtcacatcctgaactatctgctggaaaagtccagggtcgtcagtcagatgcatggcgagaggaacttccacatattctatcagctactagctagcagcgatcagtcactgatgactcatttgaagcttcaaggaagacctgaagcttataagtacacttccgattcg
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 22662
  - dna_start: 22662
    type: intron
    nucl_start: 705
    seq: gtaagtaatctgttcattattagaaaagaatagctgtaaccgcccgcttcgctgggcatttaaaattaacattattattcctcacccccacaaagatcaattaacgcccccgcaactggtctagggagtccaacacttatataaatattagcctatccattaagtacatgtattttctaaatggataccaagtttcaaatcaatcggatgcatggttcagtatttataacggaacatccgtaaaactactgtaattttatatattagtatagataatcatcatacaaaattatattttttttttatgggattttatgatctggtaacctgacctgacccttaggtcaagtcttgttttaatgtatattcttatttttatgaaaaatgataatatagagtgaaattaaatgaagatgattaatttgagacattaatcaactgagatgacattaaatgaaatgagatgagatgatatgggatgaaatataatctcagtaaaatggtggttatttacttgttgattttttcagtgggatgtttggagaatcccgagaagctacgtcaagcggctttatttcattttcccacttttgtgcactttcacaaatatgaaacagttaataagccaccgttattacacatttaaacctgtaaaaacactaaaccatccaaatccccatttatccaatgcccctgacgttaatttgaatcttcccaatctcactccgcag
    dna_end: 23393
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 235
    nucl_end: 918
    prot_end: 306
    translation: TSHMSQRANDQEQFRVVQEAMKVIEIGESEQREIFEIVASVLHLGNVKFVQNDKGYAEILSHDANSGNAAD
    dna_start: 23393
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 705
    seq: acctcgcacatgagtcagagagcgaacgaccaggaacagttccgtgtcgtacaagaggccatgaaggtcatagaaatcggcgagagtgaacagcgggagatctttgagatcgtggccagcgtcctgcacctcggcaacgtgaagttcgtccagaatgacaagggctatgccgagatcctgtcccacgacgccaacagtgggaatgctgctgat
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 23606
  - dna_start: 23606
    type: intron
    nucl_start: 918
    seq: gtaagtgtcctgctaacttatagcatgttaatgtttctctttattagattgcgctggctagtgaaactggtgataggacctcttgtgagtccgcactaccaccgccctgcctatttctgccgtaaggcagtaatgcgtttcggcttgaagggtagggcagccgttgtaactatactcgagaccttagaacttatatctcaagatgggtggcgcatttacgttgtagatgtctatgggctccagtaaccaattaacaccaggtgagctcgtccactcatccaagcaataaaaataaataaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaagaaattataatatttattcgactctatcgaatctctgttctcttttag
    dna_end: 23976
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 306
    nucl_end: 1181
    prot_end: 394
    translation: LLKVNATALREALTNRTIEARGDVVSTPLDVEQAQYARDALAKAIYDKHFSWLVSRLNSSLAPIEKDAKSSVIGILDIYGFEIFPKNS
    dna_start: 23976
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 918
    seq: ctcctaaaagtgaacgcgacggcattacgcgaggccctgaccaataggacgatagaggcccgcggcgacgtcgtcagcacacccctggacgtggaacaggctcaatacgctagagacgctctggctaaagctatatacgacaagcacttcagctggctggtctccaggctaaactcgtcgcttgcgcccatcgagaaggacgctaaatcttctgttataggaatcttggatatctacggctttgagatattccctaagaacag
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 24239
  - dna_start: 24239
    type: intron
    nucl_start: 1181
    seq: gtaggaatttttgatcagcttaagtgtgcaatgagatctgagacatccgttcttttatgaaggtcgtattttcagtttgatttgattttttcctacctatgctgatagccttgagaggctatttcagcttctctttgactgtaggtgagctcacggggctcaaactggagtgttgctaacacttgcgacgaagggctctacgagtaaattaacccagagtttcttgccggatcttctcagtgggtcgcgtttccgatctagtggtagattctgcgaagcacggctcttgctagggccagtgttagcaacactcccggtttgagccccgtgagctcacctatacgtcaaggagaaactgaagtagcttctcaaggctatcatcataggcaggataaaaacattataaaaaatttaatgataggttcactttcatttgcttaaaggcaatggcggttaattaaaaggcgatcgcttggctgttcccctgccatagtttatctgaatctaccgctagtacgtcggtttttaaaacagaaaatgtactaagccattaaattttattaatgtccattgactgaaaccctggtggtaggacctatcgtgagtccgcacgggtaggtaccaccaccctgcctatttctgccgtcaagcagtaatgcgtttcggttttaagggtggggcagccgttgtaactatactgagaccttagagctcatatctcaaggtgggtggcgacatttacgttgtagatgtccatggactccagtaaccacttaacatcaggtgggctgtgagctcgtccacccatttaagcaataaaaaaaaccatcatatttcag
    dna_end: 25078
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 394
    nucl_end: 1351
    prot_end: 450
    translation: FEQFCINFCNEKLQQLFIQLTLRQEQEEYLREGIEWEPVEYFNNIIICDLIEARHK
    dna_start: 25078
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 1181
    seq: cttcgagcagttctgcataaacttctgtaacgagaagctccagcagctgttcatccagctcacgctgcggcaggagcaggaggagtacctgcgggaaggcatcgagtgggagccggtcgagtacttcaacaatatcatcatttgcgaccttatcgaagccaggcataagg
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 25248
  - dna_start: 25248
    type: intron
    nucl_start: 1351
    seq: gtgagaatgaagcttccgtatttaataaaatcacgaataccattagttattattattattttacaaaatttatttaaatcttattaattacacattttttttattatatagtactacataaaaaatattgccattgctgacggtatctacgacacaagtcaccagtattattattattattagataattaattatctatgtatattgatgggatgatgggacggaaaaaaatcgatcctgatttaaaaaaatcatattttcaaaacgttttattaacattatttaccctccatcgtattagtgcagctaaatgaaacgatagtttcataaaaaatacattaatttacttttaaaaaaaaaaccagcaatgaaacacaaaatcaaaaacagctgatgcgcggatcaacgaaaccgcgggcgcggcgctgataccgcgctccccacaatttacaactttttaggtacaaaatgttcgttttcggaaaacttttcctaacaaccagtttatacaaagaatgtaggtacatatctgtgtgtgtgtgtgtgtttttttattgcctttgtaggcagacgaacatacggcccacctgatggtaagtggtcaccgtcgctcatggacgtcagcaatgccacgggcagaaccaagccgctgcctaccttaatgtatgtatgtgttgtatgtagtatgtgttgcaaaattgcattttgttgtacacgaatccacgggcgcagttaatacgcaatacactaataaacaacacaacatgttacgattgccaatgtgtcaatgttttccag
    dna_end: 26046
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 450
    nucl_end: 1506
    prot_end: 502
    translation: GIISILDDECLRPGDATDASFLDKLNQHLDGHQHYKSHRKSDTKTQKLMGRD
    dna_start: 26046
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 1351
    seq: gtataatatcaatactggacgacgagtgccttcgtcccggggacgcgacagacgcgagtttcctcgacaagctgaaccagcatctggacggccaccagcactacaagtcccaccgcaaatccgacaccaagacccagaagctgatgggccgtgat
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 26201
  - dna_start: 26201
    type: intron
    nucl_start: 1506
    seq: gtaaatttttatttatttattgctcaaataggtggacgagctcatagcccacttgatgtttaatggttagcccatagacatctacaacgtaaatgctgccacccaccttgatataagttctaaggtatcagttgccccacccttcaaaccgaaactgcttcacggcagaattaggcggggtggtggtacctacccgtgcgggctcacaagaggtccaaccaccatataatcagttcatctcgatttttgtcgtctcctcacagtctgcaattaggggggatattattaccaatgtttgtttgtaacggaatctttgaacgtcattttgacagacttcaaaacgcccgattaacttgaaaatttccacaggcatgaagtaccgctgctcatatgcaataataatctcataactttgatctaataccctattagttcggtttttagataaggtttatcttactgtccccctaattgctatcagtactgatcagatcagcaccgccgtcttgtcatcggagaatcggtcccacgtcctaagacacgcaccagctgacccccactcatatcctcag
    dna_end: 26773
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 502
    nucl_end: 1665
    prot_end: 555
    translation: EFCLVHYAGEVTYNVNTFLEKNNDLLFRDIQSLMASSDNTIVGCCFKVTFSNR
    dna_start: 26773
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 1506
    seq: gagttctgcctggtccactacgccggcgaagtgacttacaacgtgaacaccttcttggagaagaacaacgatctcctcttccgcgacatccagagcctgatggcgtccagcgacaacaccatcgtcggctgctgcttcaaggtaaccttcagcaaccgc
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: 26932
  unmatched: 0
  prot_start: 0
  stopcodon: 
  downstream: 
  additional: 0
  prot_end: 555
  ID: 9
  dna_start: 18633
  reason: gap to next hit
  downstream_gap: gtggatgggcataggggatatgtcacgcaaaaatgtgtgccctagtaaaaaaaagcatattgcgaaatccttgaatgaatgaacgaatgaatgaacgaatgaatgaatgaatgaacgaatgaatgaatgaacgaatgaaaattctttattgcacaaaatattgtacaaaggcgaacttaacgtcatccaggcattctcttccagttaaccctcgttgatgaagtgaaacattcaagaagtgcgtagctatgataaagttcatacatggcgataatttaaagaattacagtagacatttgtaaaatgagtacgggatcctctaggtgacttgcagcaccgtccctttgtgtttttttttttggctgtttttttttttgatcgttttttcttttttttgttgtgttttttttgcattgtttgtgtctgttgcagtctttttgtttcttttgttgtttttctttcttttcttgtgtatcttttgctctcatgttgcttgatccttttgttgtcgttctgttttttgttttctct
  upstream_gap: 
  target_len: 27463
  strand: +
  target: gi|56194950|gb|CH383895.1| Bombyx mori strain Dazao Scaffold004451 genomic scaffold, whole genome shotgun sequence
  upstream: agatggcgaaaatcgtcgacagtgacatttcggtgaaatgtcgcgaaaagggtcccgggctcgctcgatactaataaatgagtcgactattatcaaagccggcaatctgacttttggacaattattggtaaataaaaaaaacgcattattgactttgtattccattggcagtcacaaaactcttcggaacgacatcttatataaataacaggttaactattaacctttatttaatgcaggttttgaaccgtattctttgaaggagacgattatattcaaatcaatctgtattgaaatatcaataacatttttttgtccaaatgcacagattgccacctttgataatagacgactcaaataacaaaaaaaaaagacagcattaaattttcttatacacgattacaaatgcatatatatacaactagcggcccgctccggctccgctcgggtctttaacaaaaatttcaacgatttttgacgttgtttaattttttttaaataaaagaacacgtatgcggcataactacaatagttgtgattaataatgtgttctacaaagtcgtagtcgatggacaagctcacctggtgttaatggggttactggagcccatagacatctacaacgtaaatgcgccacacaagtctcaagtatagttacaacggctgccccacccttcaaaccgaaacgcattactgcttcacggcagaaataggtagagcggtggtacctacccgcgcggactcacaagaggtccttccaccagtaagtacctaccccggatacacattcggaagtaacgatgctacagacatacaaacagaaagacagggctataattaagacagctctgctagcgtcttagctaattaaacaaacaaaacattaacattatttaaactaaaccctaaatagctattccaatgtttgtttttcccatcaaattgccttacaaataacttagctctcattaaatagtttcgagcgtcacattacggatagccatccgtgtggttagttcgtacaatgggcttcatacatttcatatactacaacttgctccttgaaaggataacaaagttacggtgagcgttgatttatgttacatctatatattaatacgtgaagcaaaaactttgtatccctttttacgaaaattgcgcggacggaggagtatgaaatttttcacacttatagagaatatagagaagaagtgcacaatgctaatattttttttaaataatgcatagaagatacattaaatcaataaagaaaacattacacacactacataccatgtatttgacgcacacacgcatgcatactatttattgtcaaacttttgttcttgacgtcttttgtcaaattgagattaaatattgtttgtctttgttaatattttttatagtgtagtcttggcgaaattagtgattatagaagtataaaatacaatcataatagtatacaaacttacaattccaattaattatagttgaatttcgactactgccgggacctctagtctgtaataatattgtgatgtgcccttatgtgtaaaaaaacagccgacgggggctaattgtaactcaaagacctctcgacgctactggattgactagtgaacgatctcacagggctcaacctgagagaatttgctaacactggccctagcaagagcagtgcttctcagaatctaccatcggatcggaaacgcgacccactgagaagatccggcgagaaactcagtgggctgtatctgtgggttgattcgctcgtcgacccctttgtcgcaagcgaggggttcgacgaggacggtgaccggtgcttgaggtacttaaaagcaccgttaatggatcgggaggatccgtaatgacgtgttttgggcgagaaactcagtggcttaggtcgtacagcagttcgataatgagtggatacccttcagcaataaagttcaatttcgtttgttggcaggctcattaggccagtttccgtacaaggcgtg
  score: 0.576
  prot_seq: MEHSLQHRERVGVQDFVLLEDYRSEAAFIDNLKKRFHENIIYTYIGNVLISVNPYKNLPIYTEEKTKLYFKKAFFEAPPHVFAIADNAYRSLVYEHREQCILISGESGSGKTEASKKVLEYIAARTNHLRNVENVKDKLLQSNPLLEAFGNAKTHRNDNSSRFGKYMDIQFNYEGGPEGGHILNYLLEKSRVVSQMHGERNFHIFYQLLASSDQSLMTHLKLQGRPEAYKYTSDSTSHMSQRANDQEQFRVVQEAMKVIEIGESEQREIFEIVASVLHLGNVKFVQNDKGYAEILSHDANSGNAADLLKVNATALREALTNRTIEARGDVVSTPLDVEQAQYARDALAKAIYDKHFSWLVSRLNSSLAPIEKDAKSSVIGILDIYGFEIFPKNSFEQFCINFCNEKLQQLFIQLTLRQEQEEYLREGIEWEPVEYFNNIIICDLIEARHKGIISILDDECLRPGDATDASFLDKLNQHLDGHQHYKSHRKSDTKTQKLMGRDEFCLVHYAGEVTYNVNTFLEKNNDLLFRDIQSLMASSDNTIVGCCFKVTFSNR
  prot_len: 964
  status: incomplete
  undetermined: 0
  mismatches: 0
  matches: 555
  dna_end: 26932
- matchings: 
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 572
    nucl_end: 1832
    prot_end: 611
    translation: QFDDKLVSHQVKYLGLMENLRVRRAGFAYRRTYEAFLER
    dna_start: -5647
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 1716
    seq: caattcgacgacaagctggtctcccaccaggtgaagtatctcggtctgatggagaacctcagggtgcggcgcgccggcttcgcttacaggaggacttacgaagcgttcttggaaag
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -5531
  - dna_start: -5531
    type: intron
    nucl_start: 1832
    seq: gtatagtggagtatctatataatgcgatcctcattgcacagcctggagaaactcataattcttggaccaatggaggggaagcgcgctagaggaagagcgccagatagatgggtggaccaactcgaggaggtgactggaggccagatacgggagcggtacaatggagcaaaccggaccgatggacaaatgacatacagcaaatctcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgcgtggcgcgttataaagnagccggcatgtcaataactggtgtcgctgctttcaacaactgagtcgaagtcttcccttctgcccttccggcagcacagtacatcaagtgtcttgctagaccggacacttgaggtatttatttatatttatttatctatgtataattagggcaagacttctctgtacaacccaatttttttttgttctttttatagaagcagttttacatactttaaataactcaatacagtaagttccgcctataacgcggtacacttattacgcgatttcaatcccccgtataacatggggatttcccacatacatatttctgtactgtgaaatttataattatttctacagttcataattagcttcgcgtacctttgcacgtgtgtaaattgtgttattacaaaattaaattattttattaaaattgtctattaaaaggtgtaggttaaattttatttttataaagtttattaaaaaaaaaaaacattacaagttaaacgcgtttttcaataacgtgaaaccaatctgcgttataaagatattactgtattgcttcttcaatattatggcaatatacatatattaaatttttctttaagtttgtttatcactacactcctacgcgattcgacgaggttcaatgaagctgcaaatctctggatgtgttcagctagcacccggtagatggcgctcccattccatctcgttgtcttgcag
    dna_end: -4492
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 611
    nucl_end: 1946
    prot_end: 649
    translation: YKCLSAETWPNYRGAARDGVQRLVEALQYEKEEYRMGN
    dna_start: -4492
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 1832
    seq: gtacaagtgcctgagcgcggagacgtggcccaactaccgcggcgccgcgcgggacggcgtgcagcggctggtggaggccctccagtacgagaaagaggaatacaggatggggaa
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -4378
  - dna_start: -4378
    type: intron
    nucl_start: 1946
    seq: gtaagctacacactcagtagtctaagatctcctattcaatttgtattattatgtgacattaatttttacaaaatcttctttttctccaccttgtcccactaggtggggtcggcactacaaatttttctttcaaacacacacacgcacggacgcacgcttgtacgcacgcacgcacacaccatgtcttcttcggtcgcattcattattacaaaatgtctgcgaataaattctgagacgcaacagaaattctcactgatggtagagtgtcttgtgagttcgcacgggtgggtaccaccaccctgcctatttctgccgtgaagaagtaatgcgtttcggtttgaagggcggggcagccgttgtaactatacttgagaccttagaactcatatttcaaggtggctggcggcatttacttggttgatatagctagttcacccaattagagataaatgaaaaatcgccattcaaagtgttttgtctcattccctcgccagtcaaaaccagtatatgtctgtctcgttcaaattaaacggcatggattgtgcaaaaatcgaccttactcaccaggtggcttgccagtaccaagctcacttcttacacccagacttcgtgctcgtgtttcaggatatgtgacgtcactattaaccacccacccaactccaattcgtttactcttctaatgtattacattagtggcttcctaacttattatgtctactatccacttttcgaataaattattttttggcgcccccattttttcacctacttaaaaaccactatagtttcggtcgagatctcagtcggttgctaagagtcctacatgaaattacaaatcccctcccaagcctatataaaacgcccccttttttccgagacttaccgctcctctttaggcctgcagcacccacgagggggcgttatcacccactttgggaaaggctgcattacatggaagtaattacaagaggtgaacaatcaatatccatatatttggagatcccgttaaattcagtaaaaagaaatcatgaaacattcctatcaatgaatattccag
    dna_end: -3321
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 649
    nucl_end: 2188
    prot_end: 729
    translation: TKIFVRFPKTLFATEDAFQIKKNDIATIIQSRWRGYYLRKRYLRMRNAAIVIQKWVRRFLAQRLRERRRKAADVIRAFIK
    dna_start: -3321
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 1946
    seq: tacgaaaatcttcgttcgattcccgaagacgctcttcgcaacggaagacgccttccagataaagaagaacgacatagccaccatcatccagagcaggtggcgaggttactacctcaggaagaggtacctccgaatgcggaacgcggccatcgtcatccagaagtgggtgaggaggttcctggcccaaagactcagggagaggaggaggaaagccgctgacgtcatcagagcttttattaaag
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -3079
  - dna_start: -3079
    type: intron
    nucl_start: 2188
    seq: gtacctttatttgaagataagcaggcgagctcacgtttactggaacccgccagatatcatgtgaatgtgtccacttatcttcaggtatgagctgggagtcttaattgttttgtaatatggccacactaagggctttatcacattagaggaaactcaagacttggcctaatggtctagataccaggccataaactccaaaaaaacccgcattagcgaattagtgaatagcagcgtagacgccattttgtactgtctcgtacaaacgccaacacctctaccctgccccactacagtccgtgtgtcttcatctcttaagtcagtttgtatcagatgcaacaactcaaaaaatgtaggtcttgacattcgcaggtaggagcgaaaatgttttggattttattttttaatcgcagccgctcgcaaagcgctagtatgataaggccctaatactcgcccatgctgatttttttttattgcttaatgtatagcattataccagcagtagatagacgacaggaaccagaagcagcagagagcggcagcggtgcgatcacctgccggataaagcaataacacctattatttttgcacataacaacatacaaattgccaactttttcttaacatttttactgcctttgaagccagaggatcgtgcggcccatttgatggtgagtggcttccgtcagtctaggacgtcagtagtgacataggcacaaccaagtcattgcctaccaaacttaatatcattagacatcttctgttagacacccggtgcgcagaaacaaattctgaagtcttagatgaaccagaagacgtagcgtgggtaggcctctcacaaaatgaaccaaagacctattgaggttcacaaggatccgctgggtgcaagcagcgcagaatcgatctttgtggtgaggcttgggggagacctatgtccagcagtggacgtctgtgggctgataaatagaataaggagggaactggttcactgtccacccggtggtaggtggccacgagtgagcgcgacctcgccccctgctattgtaactgttagttctatcagagcttgtaacggaacacaacccgctag
    dna_end: -1992
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 729
    nucl_end: 2457
    prot_end: 819
    translation: GFITRNGPETPENRRFLGVAKVHWLKRLSAQLPTKLLDLSWPPCPSTCREASEELHRLHRAHLARKYRLALSPDDKKQFELKVLAEKIFK
    dna_start: -1992
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 2188
    seq: gcttcatcactcgcaacggtccggagacgccagaaaaccggcgattcctcggcgtcgccaaggtgcactggctgaagcgtctctcggcgcagctcccaaccaagctgctggacctgtcgtggccgccgtgcccctccacctgccgagaggcctccgaggagctccatcgcctgcaccgggcccacctcgccaggaagtacaggctggccttgtctcctgacgataagaagcagtttgagctgaaggtcttggccgaaaaaatatttaag
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -1723
  - dna_start: -1723
    type: intron
    nucl_start: 2457
    seq: ggtgagttcgatacgaagtttatttttttttatttttttttcttatggcaacaatttagttttctttaaatatatttggtgggaatagcgatttatcattttatcaattcggtgttccttccaatcgaaactagtaataatggcggattatctattttaaaattcgaggaattgtaaaaatgtggtgaatagggtcaccactaaatattatctgattaattaagattagataaaaagacgagttaccaatgccaatcacaatcttcactcattttttcacatatttttatataggcgaatagttctaaggcttctttgaacgagcatatatcggctcaaacagctactgtttcgcgacagaaataggcaaaatgatagtcacatagataaaacaccactaagatcaatcaggaaggtgacaatgatagcctatagcctcgaatctaagcacatcactcctgcataataattctattatacaatgtacaataaccccaaggccaacgcctggcaacatactcttactatcaatatacataccaaccaatagtcggtataactccacttaattatagcgtaccaaaccacgatactcaagataaccggctcagtcaggcgacccagcagcagttaacacacaacccaaacttattccttcctggcgcaagcatgtacacngcacaatagcaaacaggcgagtcaccatagccacgttataatcccataccgtaaccaactagatacacggtcttcctcacgagtaaaaaaagaaacagctaacctccagcacgcgtcgcgggaacaggtcccgtgaacgaacgcctagagtcccgagcaccggaccttgagggacaccttcatggcgtcgccggcctggccgagcggcgaggaactcatcgtaagtgacgacacactgcacgcctgcatctgtcgacgtagggatgccaccatagacttgtgcatcgaagtatcaattgcatgacggctgtctcacacttaaaaccggaccgaatgaccaccgatacaggcacactacgccccccaccggtccggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccggggcggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgc
    dna_end: 0
  unmatched: 0
  prot_start: 572
  stopcodon: 
  downstream: 
  additional: 0
  prot_end: 819
  ID: 24
  dna_start: -5647
  reason: gap to previous hit
  downstream_gap: 
  upstream_gap: tactgagactttagaacttatatctcaaggtgtgtggcgcatttacattgtagatgtctatgggctccagtaaccacttaacaccaggtgggctgtgagctcgtccacccatcgaagcaataaaaaaaataaaaaaacctcaaaatgagcgggggctttggaaccattgtactcagatccaataatcacggatcaacaccaaatttgactttgatttcaaagcataaaattttgatactttagatcgtaattagacgaaaaaaaaatatacatggcatgaaacagtttgcttttgaatttttaataaattgaccacatatgaaacaaaatgcatcagcatcgtatttcgcactttcgtgacattttgagtttttctgggcttgtacaaaacacttgatcgttgtctatgactcgagtgccatctagtggcactgtgtaaacgtaaacacatcagtctcatagcgcggtttttttgaaagtattaaaatttataaaaaaattaaaaaatgattattattattattactaactatcacgaaagcaaaatttataccaaaaaaaaggtattttattttcgtttttgttaataattaaccagaaaaacctagtataaaggttaggacaaaaaacgattttttttttgtggagttgtgataatcttcaacatcagacggactgtgaggattccattccatacgaatatgagttaacttttacgctatcgagaacgttaaaaaactcgcactaagcacactgattaacattaaattgagactgcgacattaaattctagtg
  target_len: 6442
  strand: 
  - 
  target: gi|56185721|gb|CH393055.1| Bombyx mori strain Dazao Scaffold016398 genomic scaffold, whole genome shotgun sequence
  upstream: 
  score: 0.256
  prot_seq: QFDDKLVSHQVKYLGLMENLRVRRAGFAYRRTYEAFLERYKCLSAETWPNYRGAARDGVQRLVEALQYEKEEYRMGNTKIFVRFPKTLFATEDAFQIKKNDIATIIQSRWRGYYLRKRYLRMRNAAIVIQKWVRRFLAQRLRERRRKAADVIRAFIKGFITRNGPETPENRRFLGVAKVHWLKRLSAQLPTKLLDLSWPPCPSTCREASEELHRLHRAHLARKYRLALSPDDKKQFELKVLAEKIFK
  prot_len: 964
  status: incomplete
  undetermined: 0
  mismatches: 0
  matches: 247
  dna_end: 0
- matchings: 
  - dna_start: -37834
    type: intron
    nucl_start: 2457
    seq: gtggttccggtggcatctcttttacgtcctttgatttctggtggttcctgtttttgactttctcgttagcttattggttactcagttttctctgggttggtacgttgctgtacttttgccgctaggtgctcttgtcttacggcattgtctctggtgttaactttgacgctatcgagaacgttaaagaacgcctcgaattatatacagtctgtacgtagtagtgcgtagccacgcgtcgccatgcgcgagcgactgtttcttaatattttatcgccaaacgaatttactgtcgtaaaatgtccttatatgggtctagatatctatacctgtgcaaagcaatatcaatgtcttccgagatggcgcattttttctattgtattgtttagtagtcgtatttatgacctcaaagcttctggaatccttggtacgatgtgagatcgacgatcgaaacctcaatcgcgttatacgttggccatcgcgcgattggagaacatggaacgcgttattgttggtcacgccagaaaaaaccgtgaaagtggtgcctacccacacgggttcacgttgcgtttgccactcatgaatacacgatcgtagggtctaggtataagcttctgagaattatgtctattacccggtttatatcttagtcaccattttggagaaccacgtgatgagttatgcgaaacctaaagcgttaagggaggcattgtagtccgtctcttactctgaacgggttctgatcccgagcggagatcggtcgttgggtgatagagtgtaggtgagtcgtttagtgagtagggtcataaattccattccttggaaccgcggtctgctcccaacgtctgcggatcgtgtcgttccacttgccccgcatgccccctaggcgcggataactcgtaggaggttcgacctcaacccgaaaaaaaaagccgttttagtcgccagaaattggcgcaataatgccaaagcccgaacagccatatcttatcttgagcttatatgctttgaaaacaattgatacttcaattcctgcacggagataaagcacatggacatctaggtctgtgtaatcattgtccttggtaggccatcgacattcgcaaagcatgtactgcacctcgtcggtgtaaaattggcaaaatgcatcacctaagtgaagatagcgttcaaacgaaatggacctaacgcacaagattggcttgtgttattagtcaccactgcatgaataatactcgtataagataaatctcatgagctcaagttgaagggcaccatttgaatggaaaaattggtaccggcctgcgggattcgaacaccgacacagttgcaccgccgttacgaatgcaccgggcgttttatcgtttaggccacgacgaccttaaaccaggcaggttataaattatcttccacattcccgcgattctcggtcctcaacgcagagttttatacacgtggcggttagctatcatataacacatctgacagattggtaaatctcgcaaacgacattttcaaaataagcttgcttaaatacaagttccgaataacaacatatgaaccgtcggtctaccgagaaatatcacccgctcggtggaagatcttccctttgtcgtatacttcccaaatccacatgatgatgatgttaaaaccatgcttatgtagcggtaaaaataaagatttttcggcggctcgccggaacggttacgttttgccaccgacccggtttccgggctcgaaggaatcatttggaaatcgtcgccgagtgatgagaaagaattgcacaagcgacgctctagagcgtcgtgtttcgtcgtcgatctgacacaagagtcgtacggaagtcgagtcttttaataaggaacacctgatgtattggaaagcctaaaaatgtgacagtcgcggtgatttttagggaagaagtgatcagattatcagaagacattcccgtgtttggaatgaggaccaattaaggacctcgtacgaagcggggggctttcgtcgcctagatttcaaccgtttttttccttgcggtctgctcccaacatcggctgaccgtcaagttccacgtaaaccgcgcgtcccctaggcgcagacacctcttatgaagttcggccccctccattcaactctagagaggaaggtcgagttatcataaccatctgcatctagaaaagaattttgtagttcgtatggtctaggaaattatctggatcggcgttcattcttaccatctagagtggaaagtatggtcctatttaacagtctctttgcctagatctgttggccacgtttgactcctagtaccaaccaccttgtatttcctgtgacatgtccgtctgaatggaactttgatgctgataaagatgagtccttgtcgttaagcagcggttcatctatggcaatgggtgggccataattgaatttcctaaagagttcacagccttggggatgtgcccttatatatcccatcctttccctcctcaatattcacgagtgacggttaccgttcgcgtccagacagcgcggccaactgtgtctgtgcaaatcgaatagcttcatgaatttccttaagtcacaaccgtattgtgtacgaatttgaacttgataatcgcgtgatctttgctcgttacgtgttcgaattgatttggatcgggcaaatttaacgagacaaccgtacgtttccgctgttacggtaaactaaatgtcaaaagttacttttttcttttcattttccgacctatgctgatagcctattcgaacccttgcaacgaagggctcggcgagtaaatgaagccatagacacagcctactgagtttcttgccggatcttctcagtgggtcgcgtttcccatccggtagtagattctacttgtggtaggacgtaccggcgccatctaggcgggcttcggatagcctgccgaccgagagggctggtggtcgtggcgccgacgatcgccggtccggcgtcccgaggaggatgggagagatgtgctccgcactaaacgcttcacttcccccctttgcctcttcatgagttttgtctcatgcgaggtttggacgttggttgttgagcgacaggagattttagtcagttcgactctgatatgctccgccctccatccccactggagggcggaagtcgggcgatttcctcctgaccaaaaaaaaaagtggtgggacgtattgtgagttcgcacgggtaggtaccctgcctatttctgccgtgaagcagtaatgcgcttcgatttgaagggtatggcagccgttgtaaccatactgagaccttagaacttatatctcaaggtgggtggcgcatttacgttgtagatgtgtatgggctccagtaaccacttaactccaggtgagctgtgagctcgcccacccatctaagcaataaaaaaaaagattcagcgaagcaccgctcttgctagggctagtgttggcaacgtcttcaagttagagccccgtgagctcacctacacgtcaaggagaagctgaaatagcctctcaaggctatcagcataggtagggggaaaaaaggcttttttctaagaaacctcttctaaaaaccctcgagaggattacctgaatgctattacattcaaaattgatgagtgtataagtggttaaaagttacagagaataatatgcaatatgtgacaattaactaatgaagaccgaattatcttaatactaacaataatttagagtttaatctacgaactaaaacatactttatagtttctctatgactgaagctttgttttctgaggggcttattgtaacaacaatgaaactaaagataaacagttacacgatggataagctacgcgtggaaaactttattgtcaacgaacaaaggactgtaatcttcatacgttaggcatataaataatattcgaaactaggcttttgtgccttcgacacaaggaatactattcaatgtaataaaaaacactggaatattatatacacatagtagcgcttatttggaatggcttatattagttatgaattttgtttgtcgactttaattcactattaggagagagtttacgaagaatactcctattcaaaaatttaggtaaaataccgatgatatatcaatttcaatattacaaaaatgtatcggaaatagttcattcttgaaaatgtatataacaatactttagacgcgatgattgttcgctgctgcttctttcgtcaatatatgaattttctgttatagtaatttttatagaatatgtatctataatctaaatttcattgtcaaaatcatatcacgtaccttcatatttagaatgtgtataaacgtaaaaagcatgtttcactaacgaaattaatagtaatattattattattcacggcgaacttattgtaagtacttcatgagtcactgtttaaaaagttgctttagggttgccccttatggaaataagtcgtttaaggaaataagcaaaggcattttttttcgtgttaacacctcttagggctttaagaatcattcaagtttaaattatgtaatttcatcgttcaattttcaactttaagttgttctgatttcttatatatttgaatcgttaaaagatcttctgaagtaaaaatactgaagtaagtcggaaatttggaatatatatttttttcatcatagtagctcctgtttatctatcaatctctagaatgtatgatagtggataatagtgttaataatagaatagacttttatcattaaaatccttttaccataaaaatcgaagtagaatctcactactgaaagaaagaaaaaggcatttgtatcttgtaatatggaaaggaatttagtggttctctatattaatataataccgcctaattaatcagcttactgcggaaacttgctatgttatgattgttcctaaacctatttattgtatatatttgtttgtatttacattatgatattccagttgtcacgttcgtcgtctggcaacattgggtgtacgtagggatttggattttttctatgttttgtaggtactgtatgtatatcccatagggagttttgcaagtaattattcgggatgatttatgcaaaaacctaacaacaaccgttttcataatattaatcgcaatcggataaaaacatataaaatgaagtacgtaattgagcagcattacataattcaataagtattttatatattataattatttaaagatcattcagtagttattgataagggcaaacaacctaagcaaaattcggagaaaaaccattaaacaaattggattcaactcggttgtgttctaagagttaattactaattataaaacacattcaatttacataaacacataacggtactaatcaaacgacaacctatctgacattcgaataatattaaacgttatgtaagcagttagcaaggcttaataactttttttatgtctttcgcggccgctttcaactgaagaatgaatatgagatacagacagtaaaatcgattttgaaacgctaggatcacatcataagattgagttcaacggtacttcgataaggctatacgtcatgataatcgcttattcgttgccgccgctaactgctcctcggatcctgatcacgcaggagtcagtcaccgtcgacgccctagacacgtccttacggatccattagatccaataacctttgcattagacgccttcagctcgtcgaactcgacaaagcgttcgacgtgcaacctaacccatgaatcagctcgctgagtttctcgccggatcttctcagcgggtcgcgattccgatccggtagtagattcattcgcgaagcacctgctcttgagctgctaggtctccttcggagacgctcgggcagctgttagcaaatcccaccccttctggctgagtctttgctcgcccacctgtcctggtaaactagaaaggcctccgggccaccagtaatccttcaatcataaaaaaagactgagttgactgaatcgaaaatgaatttcaacggtagccctaacacgatagctgtcaacggcaaataatggaaaattcaaattagtattcaacgaaacttgactagagcaggcttcgggaattccgcgcgcgaatgtcgcgatcaaacgaatgtgccaacgtgtcgtgttcaggtttcgcacgcataaacactgttcaaaacgacgtacgtaatctgcttaatttatgctcaatgtaaacagtggatactattttgcggtagatgacccgcctgctaatgagctgttacggcaaattacgtcatttttaaaccgtgagctcaaactatcaataggtttacctccccttcaaattggtgcatatgacggcctcgatacacagaaataggcggaatgctgctagtatactgagactgagatttacgttgtagatgtctatgggctctggtaaccacttaacaacaggtgggctgtgggctcgtccagccatttaacaaataaaaaaagtagatttccatttcggctgacatctgtgttaagactatcacgaaaaacatctttctttttttcaacgtttctcaaagtgaatcttttttcaatgtttcccaaagtgagtcttttaatatttagcgtgcgagtacatgaaacatacctacatacgtataatcaaaattcttgtatttcgaagcgtcctaaattacggtgatcagtacgcgtgagtcacccgtttaaattaacttatcagtctacatttcaaggcatcataaaatgtataattaaagttttcgtttactgcaatcgcggctcctttattacaggtttcgggaaaggcaatcgcctatacacaatgatggcgcctattccttggatttttccaacattttgacactaagacgtgattcagcagtattttaaaagcgtttttgattaactattttaactatagttgtaactataactaaacacgaaccctagcaagagtcgtgcttcgcagaatctaccacaggatcggaatcgcgacccactgagaagatccggcgagaaactcagtgggctgtgtctgagagttaataataaacggtgaccggtgcttgaagtacctagaagcaccgttagtggatcgggaggatccgagttgacgtgttttgggcgacgtcgactgctttccatgtgatgtgtgggctatctaaatgaaacgagtgctttggtcgacgatcgtttattgactgtcttactaattacttaatacaaaatacaatggttatacctatactacaactaaagtaacgtgttgttgcacatattctgtccgcaggatcgggaatgatatatcagtatctttgttagtccatatcaatttcaagatcgttcctatacatacatctgtaaagtcgaatcaaacaaaccagatgtcatcaaacgatcatttcgacaaatacattatccaactcacgttctgttcggtcgacttacttaaaattcctttaacggtgcagcattctaaattaaggaacacagtactgtgtatcacacacttatgggaatacgtacctggaatatcaaatcgttatacatgtttttagatacgaatggagtaatctttatatttgagtcgactattatcaaagccggcaatgtgacttttggacaattattggtaaatcagaaaaacgaattattgactttgtattccattggcagtcacaaaactcttctgagcgacatcttagataaataacaggttaagttaatactttatttaatgcaggttttgaaacgtattctttgaaggagacgattatattcaaatcaatctgtattgacatataaataacatttttttttgtccaaatgcacagattgccacctttgataatagacgactcatttgtcttgtgtaattcggtaccgcgtcatgcttaacaccgcatcacattaagtaaatagaaacgataatatgttgcagtttaagtaggcaacactggctttcttagaatcattgcttgtataattacgtgccttgtaaggttaatgtgtgtatgtgataaattatcaaacagtacctttggggtaaaagacgcattgaggatatttttttttttaatatttgaaaataaaagaatgagtaatagaataggtactagcaccttgtcgatttctgccgtgaagcagtaatgtgtttcggtttgggtagccattgtacggtaaaaactgatgcctataactcgtgtctcaagatgggtgacggcatttagattgttgatttttatgggctttcggtaacaatttaataccaggcgagctgtgagctcgtccacttatcaagcaacaataataaatttgatataattgataaatacgccgttacccgaagcaattacacacttatattgtttgcattgtccatgtatttttatgtttctagtggaatctttagtttaaattttgagtcacttgtaatcattttatcttcatgatatttgtgtaaacgcacgcgggtcgtgaatcccggtctaatcgtaacactcgaaatatcgaacgtattgtccacagaaactgcgacattaaaatattttagcacccagttggttcaccatcaggtgatgctgcagtggtaattgtaacaatacgctaccattcatcaagctcacgggatttcttttaaaaaaatccctacttcattgttggtagcctaagcctaaggggctattattctaactacgcgcggatggatagatgacctcacggggctcaatctggttcactggtggtaggacctcttggtagtccgcacgggtaggtatcaccaccccgcctatttccgccgtgaagcagtaatgcgtttcggttcgaagggtggggtagccgttgtaactatactgagaccttagaacttatatctcaaggtgggtggcgcatttacgttgtagatgtctatgggctccagtaaccacttaacatcaggtgggctgtgaggttgaccatccatctaaaaaaaaaaaactattctttagcaagttttttttcctacctatgctgatagccttgaaaggctatttcagcttttgcttgacgtgtaggtgaacacacgggggctcaaatcggagtgttggtaacactggccctagcaagagcagtgcttcgcagaatctaccaccggatcggaaacgcgacccactgagaagatccggcgagaaactcagtgggctgtgtctatgggttaatttactcgtcgagcccttcgttgtaagccacgggttcggcgaagtcgatgaccggtgcttgaggtacctaaaagcaccgttaatggatcgggaggatccgtaatgacgtgttgctttaccaaaagcagtgcttcgctgaatgtatcgcgacacactaagaaggtccgtcgagaaactcactgggttgtgtctgagggtaaacttggacatcgaactcttcgagatcattgactatttgaactagtactattcgcaagatgcgttttagtaatttaaaattacaacatggataaattatatctaatttaagcatcattcggccagatgagtcacagtctagactagaggcggaaccgaggtaacgagattgcatcaatccttgctcttgatttatgatgttactaaagaaaaacacgccgtctatatcgcggaatgatttacgcgctgcctaaaaaaatgaataattatttgatcgtggtttaattatttagccttttcctctatttttaacgaaatataattaatagatatcaataaaaatttcgtgaagtatcagcgtgaatataatgaatgttttctcacaaaaatttgaccacatttaatgaatggtcaatagttttgaacctgtcgttattaaaaatattaactcctaagagaattattattatagtaggcgtattgtgattgtccaagtcgccaaaattttgggaactatacacttgtcttgtgaagtggttaggtaactaaacttttttctggtggtaggacctcttgtgagtacgcgcgggcaggtaccaccaccccccctatttctgcccttgaagggtggggaggccgttactatacttgagaccttagaaattatatctcaaggtgggtggcgcatttacgttgtagatgtgtatgggctccagtaaccacctaacttcaggcgtgctatgagctcctccagccatctaagcaataaaaaaatcaaaataattcttcttcgttcttttggataacattacattttgtaaaagaataagcaacgtatttttttcaaccgaacaaaatacattatggaaattattataataataacaacaagaatcactttaagtaacttccgaagtgaggtaaagttagggatcgcttcaaaatatgtatacaacattaattcagcggtttcgttttgatctcacaaacgggtttcttctaataaatgtgattaaagaaatttgattcattacatatcgtttaagcataatcatgatcccgtaatccaaagcgaatgtacatagagaacaaccttccatcacacaggtcgttgaccccgcctcattttgcattccattgcgtgttatcaaaaaataatatacaaattattattagtgataaaaaaaatttaaggctactctttaatgtaaccccgccactgccatgctgtgttcgtgttcggaaaatatacatactttaaaaatattaggaacgtacgggttttaacaaactgcaaggtgtatgcgtgcacctgctctgtaattacacgataagaatacatacatatataaaaggcttattagatgtattgaacagttcgtatttaaatgtatactgatatgttttcttttgtcttggattcgattcggcattttcgtgggtttttttcctgcctgatcgccagtggctacgacgggctattctggcttcatcgtggctggcgggcgagctcacgaggctcagcctaagataacttgctaaaatcggacttagcaagaacaatgcttcgctgaatctgctaccgaatcggaatcgcgattcatgccctcaacacgtcattaaggatcctcccgatccattaacggtgcttttaggtacctcaagcaccggtcaccgtcctcgccaaatccgtcgcttgcgacgaagggctcgacgagtaaaataacctataaacacagaacactgagtttctcgccggatcttctcagtggatcgcgtttccgatccggtggtagtttctgcgaagcactgctcttactaggaccagtgttaacaacactcccgctttgagccctgtgagctcacctacacatcaaagagaagcataggtagaaaaaaaaagcacaggaatttagacgagaaactcagtggtttgtctctatgggtgaaattgcaagtgatcatttttaaaaataattatttgtcgcacattatttttatattccagtttgtttgactcagatgagaaaactgatgcctgcaaggtgtctactttacattgtttgtgtctatttatgtcaaaaacgtcattatacaaacgatcattatctgtcggtatctttgagatacaatgtagacgaaaaaaaaaaaaaaccttgagggattaatgacaatattcttggaagtccttttggtaaactgaattattgttcccacaaagattattatcggaaccagtcatacgcagatgcaattctatcatcgtgttgcgcaaaacataccgccgcgccgcgccgtgccaaaattgcattcctttcaaccaggtaacacatagttcgtagacctttatgactatcgatgtaaggttccgttttgtcgattgaatccgcggacgattcgacgtttatattttatgcctattgtgtatcgcgattctcatgcctgccatcaacttggattctcaaaacttatcttttgtgtgaacgcataaagaatttaatgcttccgctgcgatattagatacaattgcgctagactgcataacggctcgctttatagtaatttgcctgtctcatttatatttctgcgcatgtcagcgctgcgtatgttacaatgagcactgtctactcgcatttatgtacttagagaactattcttttttttgttgcttagatgggtggacgagctcacagtccacctggtgttaagtggttactggagcccctagacatctacaacgtaaatgcgccacccaccttgagatataagttctaaggtctcaagtatagttacaacggctgcccccccacccttcaaatcgaaacgcattactgcttcacggcagaaataggcggggcgttggtacctacccgtgcggactcacaacaggtcctaccaccagtaattcgtattaaaaattaaaatatattgatcgcgcatgatcagatcgatcttcaataacattggcattaagaggtttcccgatcacgcgatccgtataacattaaaatgcgactgagactgaacgtcacgcagtgcgccaccagaatcaggatcgtttgaataaataatttacttaaaataccatctaagggtaacgcgtgctacgaatacaaatataacccagaaaagtgtacaatttatttagaaatataaaagcgtgagatgaataatttagtataaaagcaaatcgcacacactaactaaattacctagaatgaaattgatcatttacaaaagttaatgtatctatatattaatacgtgaagcaaaaactttgtatccctttttacgaaaattgcgcggacgcaggtgtatgaaattttgcacacttataaagaatatagagaagaagtgcacagtgctaatatttttttttaataatgcataaaagatacattaaaccaataaagaaaacattacacacgctacataccatgtattgaacgcaccacaccatacatactatttattgtcaaacttaagttccaggcgtatgtcgtaaattgagaaaagattaaatatagtctaataacatgtgtaatctttgcaaaattgtgattctaaaatataaaaacatctaaaatataagaaactaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagggaggtgatgtgaggtactcatagataccgcatagtgcgctcggtcggggggggggcgtactactctgtgcccgcagtgtcgtgcatagtgcgctcggtccgggggggcggtgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcaatagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccggggcggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcggcgcgtgactactctgtgcccgcagtgctcgtgcactagtgcgctcggtccgggggggcagcgcgtgactactctgtgcccgcag
    dna_end: -24076
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 819
    nucl_end: 2676
    prot_end: 892
    translation: YSCEAVKYDRRGYKARARGLLASRAALYVLDAGGRRTFRLKHRLPLDRLTVVVTNESDSLLLVKVPRDLKKDK
    dna_start: -24076
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 2457
    seq: tactcgtgcgaggcggtgaagtacgaccggcgcggctacaaggcccgcgcgcgcggcctgctggcgtcccgcgcggcgctgtacgtgctggacgcgggcgggcgccgcacgttccggctcaagcaccggctgccgctggaccgcctcaccgtcgtcgtcaccaacgagtccgactcgctgctgctggtcaaggtgccgcgcgacctcaagaaggacaag
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -23857
  - dna_start: -23857
    type: intron
    nucl_start: 2676
    seq: gtaccttaataaccagtgttcggagtaggtaaattgattttatatacttgtgtcaggatattataatatggacatgcaattttatcgataatgattattttttaaaattgaaaaaaataattttaatcctcatcggattcaatttctatatattttatgagatgaagtaacaaaaagccctgtctaaattttgtttcatacttacaagcgtcatttctaattcaacagaaaaggacaaaatacggtgtaactattccaaggtgtttttgtataaaataaaatactgatttctttcaccattagctagcactggtagcgtagattcatatcattaatacgtttttcaccttaaaaacagatgcatgctaatttcaaaattccggaacaaatatcacaatacatatgaagacgttccagtattttggaggcatatccatattatcctctacgcttaacgtcaacgcccttaaatcaatctacttactccgacctctagtaataacacatcgacggacgcaagcctgtttggtttaagcgtcatttttgcaacattacatttgacccaattagagtttaatatttggaaaaatataaaaaagacatcatcagctatttaaatggcgtaaacttaattgaagttcccggtcaccgttctcgttgaacccgtcgcttgcgacgaagggctcgacgagtaaattataaccctcagacaagcccactgagtttttcgccggatcttctcagtgggtcgcgtttccgatcctgtggtagattctgcgaagcacggctcttgctagggttcgtgttagcaacgtcgtcaggtttgagccccgtgagctcacctactagttaacgttccgctggaatagcctctcaagctcaaggcaagcttaggtaggtataaaaaaaaatttgaagttcaattaaaaaaatcgaatcgttagtgctaataacgacaaataaaacagccctttaatgacaaagataaatgtcgcgtattaaacggaacgtcgcttaatccaaatagcctttcacctctcgatatatcgtcatttcgcattaaaagtgtaccatttccaaaactacatattcgaaattgagttaatatgcggaatcatttggtatcaccagtatttttctcagaaatactgtcaaaagagcgtagtttagggatctttttttttatttactattaacaaaatgaatacataattttatcttactttaaaagacagatatgtaactggtaaaaaataaaaaataaatgttgcaaagatgattaataatattaaaaataacacatgttaaacttttaaaacactctcctgtaaaattagtaagttttgagattatacagttttaatgcgagaagacgatgtttcaataatgtaggtagtttaaaaactaaaaaagaacacgcttaaacaccaaactaagctaatcggtttcatctttttgattcttgtttgatattggtcagaatattagagcgaagttaatattattgtattattattgttgtatccttggtccttgatgcgtgcgtctttcaacgtaatttccacaaacttcataacgtctgattaacttcaaaattagtccaaccatcagatgccgatgtcaatacgataatttttaaatccaaaggatcaatattagtgatagaagtgaaaccttcaaaaattaaaatacaatttatcttatgtatattatgtatgtaaaattttgtccttagtaggtacataattgcaaatcatcaacttttatagtatgagctaacgcactctgtgaattaaaatcttaacttcaagtattatcctaaattaaagataataacaatagatttcataaacattattaataaaccatctcatagatggcgctgtattaaaaaaacactaattcttcctatctcattttcttccacgttaaatcttataaatgtatgtgtctgtctctttctactgtcgctttttcgtttcatcgactttcaaatcacaacaatgctaaagaagttttcacttcaaaatattgacttacttttgaacttgacctttttgtcgagacgtggtatttaaaagtattattcacttgaacattccaccag
    dna_end: -21750
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 892
    nucl_end: 2777
    prot_end: 926
    translation: GDLIISVTHLIEALTIVTDYTKKPELIEIVDTRT
    dna_start: -21750
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 2676
    seq: ggagatctgatcatatccgtgacgcatctcatcgaggccctgaccatcgtgacggactacaccaagaagccggagctcattgagatagtcgacaccaggac
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -21649
  - dna_start: -21649
    type: intron
    nucl_start: 2777
    seq: gtgagtgggccgcataaaatacttttgttttcttatatgtgccaacatcggactataagtttttgtagacaataaccgaatcaatagaacgtcacaaaaagaaaacgaattaaaatggtttattaaaaaaaaaaatcccacactctaaataagaatctatcaaacagtaaatatgaaaattcgaccttaactattgatatctaaaaattaagattcattgcatttttttctcctgcacttgacatattgaagaaaatcatatttacatacacactttttttttaaatattactgagatttgagcccttcagtgattaagagcattgttagtaaacaaaaaaatacagttttgtctttgccactgacaacgcacttttgtacagtgacgtcaacattcataccagctctaacaactctatttcaattacttcatttttttttcaagtttataaccatttttccaagttttcttaatactagacgtgtaaacaagctctcgctgctaaatgctaaaactgaggtccatggacatcaccatctactttgagacatgaagtttcaattaaattataatagctgaactgattcgtggcaagcatagtacttgcccttggcagctcttaatgcatcatcatactcttagcagagcagttgtggtcatatggcatccttgtttaccttgacagctttaagcattaagtggggttttagtaaagattttcactcaatcaatccagcaccttacccctaacctacaccgtacagtaatttcttaattccattgtcatatcagcataaccctgacaagtaggtgagctcacggggctcaaacctgacgatttatttagggttttacgtaagcgatttaatgtgttccag
    dna_end: -20770
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 926
    nucl_end: 2880
    prot_end: 960
    translation: IAHSLVNGKQGGTIEVTKGTQPAIQRAKSGNLLV
    dna_start: -20770
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 2777
    seq: catcgcgcactccctggtcaacggcaagcaggggggtaccatcgaggtgacgaagggcacccagcccgccatacaacgcgccaagagcgggaacctgctcgtg
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -20667
  - dna_start: -20667
    type: intron
    nucl_start: 2880
    seq: gtaagtctcgctgctgacttgagatgaggcgacgagcccacggcccggccctgagaggctatttcagcgtaaccttaactagtaggtgagctcgcgaggcgcaaacctgacgatgttgctaacactgatcctagcaaaagcagtgcttcgcttcgacccactgagaagaaccggcggtgtctataggtaaattcactcgtcgagcccttcgtcgccagcaacgggttcgacgaggatggtgaccggttcttgtggtacctaaaagcaccgttaatagatccggaggatccgtaatgacgtcttttgggcgacgtcgactgtttaccattcggtctacaggagctaccacggtaccggttaagcattaccttcctcactgtaggcgactactggctcacagacccggaacagagcttggccgagagattaatgctcagccgtgagcccgtgaattgttgaagacatcgaatcaaagctaccctgactgtccgtccgattatattaatctttttttttattgcttagatgggaggacgagctcacagcccacctggtgttaagtggttactagagcccatagacatctacaacgtaaatgcgccacccaccttgagatataagatctaaggtctcagtatagtcacaacggctaccccacccttcaaaccgaaacgcattactgcttcacggcagaaataggcggggcggtggttaatctgatgaaacagattacctaacagaaaaaaaatctgtataatttccattctgtataattcaattatattcggctgtaataaaagctcctcgatttccctatttaccctgtctccgacgtccatcgtcctggacagccaatcatcgccttctgctaaatgtcacgctccaatactaagtggttcaattcgttctgattgacatccaagcattgcgccatcacaagagatcgatttttttattgctatgataggtgggctaactcactgtttactttgtgttaagtggtcaccttgagacatgagttttaagtcttattttttcaataaaacgggtgccccatcaaaccatatgtggtcactctctaatatctcttgatacttcag
    dna_end: -19567
  - overlap: 
    mismatchlist: []

    prot_start: 960
    nucl_end: 2892
    prot_end: 964
    translation: VATP
    dna_start: -19567
    type: exon
    seqshifts: []

    undeterminedlist: []

    nucl_start: 2880
    seq: gttgcgactcct
    inframe_stopcodons: []

    dna_end: -19555
  unmatched: 0
  prot_start: 819
  stopcodon: tag
  downstream: tagaagacagcgtagcaatcgacaactcttcgataacaaaacttgaaaacgacgcaaataaatacagagtttataacgtgaaagtaatattatcatttaattattaatttaaatatggcgattcaattatttttgtaaaactatcattgaattttaatgcagagttaatcttttttgtttgtattaaaattatataattataagcttataaaataataattatgaaacattatataatttggattgaattgtattaaattattatttcattatttaattttaagttcattgatttgtttacattgtggtttcaaacacacaacctttatatttttatttaatgaatcgtacaaagtacttaggtctcttgtttagaacatttcaaaataaatattgtgattttgtttgtttaatctagtttaaaatagtaaagtttgtattgtacgtattgtaaagtacgctgaatcgatggtgcctaaaagttaatgaaatgttagaatcgaggataatcgatactgattctaaatattatgttaattctggaggaaaatggccaaagcagtgttttggcgggaaacggtttcacgagacctcaactaattgatatgtctgttagtaaaattacatgtcaaacaattagactaattaaccatttgagaatttactatccggtcgtcgctttggtaaacattatcttgtttcatccgatatctagcagctaggtatttcgagctatcaaactgtgcaagttagtgcgatcactaaataacatttaacttgagcgttttttttatttaatttttcaaaatttcgacagcgtgacatgtcttttcccgcgcgaatagataaatttgacaatgctgagattctgtaaacaatgtcaattgtcaaacgtttctatcatttttatcaaagatttgtacacatctgttgtaaacagattatgcaaatttctttattttaaacaattgtgtaaatcgtgtttgtgttataaattcggactacagacatacaactaaacgtgattttttttgtgaagtatatttgtggtacaaaaactgttttactccatatgtcttgtacgttgctgtgtacaaatttttccttaagtttccagaaaattcagacggtagtttaaattttgttattaagattatttttttacattcaatgctgcaaatatcgaccaaaataccattactaccatctcaatgcgtacacatattaccagccatgtaactccagaggccatatgaaataaacgaaagataggcgcgtacgtgccttattgtattgtaagccagttcctttgtagtcatttttataattaaatttatttttgaaataattttttgttttattactttatctagttactgagtttaagaagagagaagtcgatagctacatttcattacaggacagaattgtggtaggcacaggatcatggtggttccacctgcatgatttaacttaccttgtctaagaaaatgaaagcaactgggacattatcaataaacgatttatttaccatactgatatagagtaaaaaacttacagcactaacatcaggtctcctattatttacaagttaataaccatttaactattatatttgactttgcatactgtacaagaaatttacattagacaacaaatgttcagcaaatgaaaaataaacattgttcttattcagagaaattaaactagattacatacatacgttattctttattataatatttacaattaactacaaaatatttatgcacatgagttttacagttcatttcgctcgaggagcgcgggcgccgccactagaacttttgacagaagctgtaagtagaacttcagcataattttggcacagagttaaattaacctttaccgcttgtcgaacacaacctgttgtattcacgacctaacaaaattcgattaacaaactaaaattacaacacagtacataatcttccccataagaatagaatttctattatgaa
  additional: 0
  prot_end: 964
  ID: 7
  dna_start: -37834
  reason: 
  downstream_gap: 
  upstream_gap: 
  target_len: 37834
  strand: 
  - 
  target: gi|56196943|gb|CH381902.1| Bombyx mori strain Dazao Scaffold002344 genomic scaffold, whole genome shotgun sequence
  upstream: 
  score: 0.15
  prot_seq: YSCEAVKYDRRGYKARARGLLASRAALYVLDAGGRRTFRLKHRLPLDRLTVVVTNESDSLLLVKVPRDLKKDKGDLIISVTHLIEALTIVTDYTKKPELIEIVDTRTIAHSLVNGKQGGTIEVTKGTQPAIQRAKSGNLLVVATP
  prot_len: 964
  status: partial
  undetermined: 0
  mismatches: 0
  matches: 145
  dna_end: -19555

